В семейном автомобиле никогда не бывает слишком много систем помощи водителю для защиты от опасных ситуаций. Например, Octavia может справиться с такими ситуациями, как: контроль за встречным движением при повороте налево и торможение до остановки при обнаружении опасности. Если вы припарковались, система отслеживает пространство позади автомобиля и предупреждает вас о риске столкновения с приближающимся автомобилем или велосипедистом при открывании двери.

В случае аварии пассажиры защищены жестким каркасом кузова, широким набором деформационных буферов и до 10 подушек безопасности, которые работают в сочетании с автоматическими трехточечными ремнями безопасности и безопасными подголовниками. Системы безопасности также включают в себя передовые электронные системы, помогающие снизить последствия аварии, такие как экстренное торможение и система Crew Protect Assist спереди и сзади.

Octavia оснащена системой eCall, которая передает информацию о местонахождении автомобиля, количестве пассажиров, положении автомобиля до и после аварии, а также о состоянии автомобиля после аварии. Систему также можно активировать вручную в любое время, нажав кнопку на потолочном модуле.

Euro NCAP присвоила Škoda Octavia максимальный рейтинг в пять звезд, подтвердив, что автомобиль обеспечивает оптимальную безопасность при столкновении для всех находящихся на борту

В категории "Защита детей" Octavia получила 88% от максимально возможного. Это подняло Octavia на первое место среди всех протестированных автомобилей. В категории безопасности взрослых пассажиров Octavia набрала 92%.